对商标行政行为的司法保护，主要体现在对商标行政行为的司法审查职能上，支持正确的行政行为，撤销违法行政行为。司法审查制度起源于英美法系国家，即法院对行政机关作出的行政行为有权进行审查。
这一制度最具代表性的国家如美国，为维持权力平衡和权力保障，司法权对行政权形成了有效的制衡，联邦法院不仅有权对行政机关作出的决定、命令、处罚、裁决等具体行政行为进行审查，也有权对政府发布规章、文件等抽象行为进行审查，对政府官员的职权行为也有权进行审查，审查的范围不仅仅局限于合法性审查，还包括合理性审查。司法权对行政权形成的这种制约，等同于对私权的保护多了--道保障，即通过司法审查渠道实现司法救济。
我国《商标法》在商标注册管理、商标有效性、商标使用管理、商标保护等多处规定了商标申请人、商标权人、利害关系人等对商标行政管理部门的处理决定或裁决不服的，可向人民法院起诉。可见我国《商标法》同样确立了对商标行政行为的司法审查制度，这一制度主要实现手段是商标行政诉讼，即当事人在选择行政救济之后，对商标行政管理部门的处理结果不服，仍可以通过.提起行政诉讼这一--手段来启动对商标行政行为的司法审查程序。
司法审查制度确立以来，商标评审和撤销案件在行政诉讼中占比大幅上升，特别是新《商标法》将所有商标争议解决改为司法终局裁决以后，行政诉讼案件迅速增长。
